すみません。「ブックマークを常にタブで開く」がOFFの時はそうなるようにするべきだった所を、設定がONの時は左クリックも中クリックもタブで開き、OFFの時は左クリックも中クリックも現在のタブに読み込むという動作になってしまっていました。
https://github.com/piroor/tst-bookmarks-subpanel/commit/7640486f7ed58bdddebda17b866dac2405037854 で期待されるとおりの動作になるようにしたので、次のリリースから反映されます（なるべく早めにリリースします）。