Netscape 6/7 は Mozilla を元に作られていて、似通った部分が多いですが、完全に同じというわけではありません。設定の保存方法などに違いがあることもあり、単純に共存させていると、どちらかが（あるいはどちらもが）起動不可能な状態になってしまうということもあります。
問題は、ユーザープロファイルの仕様が違うという点。ならば、別々のプロファイルで起動してやれば何も問題は起こりません。うちではプロファイルを3つ作り、最新の Mozilla ・安定版の Mozilla ・ Netscape 6 ・ Netscape 7 と4つのバージョンを共存させています。
やり方は簡単。プロファイルマネージャを起動し、新規プロファイルを作り、適当な名前を付けます。後は、 Mozilla を起動するときは mozilla.exe -p "default"、 N6/7 は netscp6.exe -p "newprofile"というように、起動スイッチで直接プロファイルを指定して起動するようにするだけで OK 。 Windows なら、ショートカットのプロパティを開き、リンク先の末尾にコレを書き加えておくと便利です。